Familial Aggregation of Parkinsons Disease in Iceland cd

Informacje o wieku początkowym uzyskano dla 693 z 772 pacjentów; w 560 z nich objawy zaczęły się w wieku powyżej 50 lat. Ogólna grupa 772 pacjentów i ta podgrupa 560 pacjentów została zbadana w oddzielnych analizach. Genealogiczna baza danych
Elektronicznie rejestrujemy wszystkie dostępne informacje genealogiczne z ostatnich 11 wieków na Islandii w skomputeryzowanej, relacyjnej bazie danych, która zawierała 610 920 nazwisk w czasie badania, w tym nazwiska wszystkich 270 000 żyjących Islandczyków.19 Wybrano grupy kontrolne 610,920 członków populacji. Dane dotyczące 772 pacjentów badania, wraz z całą genealogiczną bazą danych, zostały odwrotnie zaszyfrowane przez Komisję Ochrony Danych Islandii przed wysłaniem ich do naszego laboratorium.20 Opracowaliśmy algorytmy, które znajdują wszystkich przodków w bazie danych, którzy są spokrewnieni z każdym członkiem grupy wejściowej w danej liczbie pokoleń. Inne algorytmy identyfikują, dla każdej osoby w grupie wejściowej, wszystkich krewnych określonego typu, takich jak rodzeństwo, ciocie lub wujowie. W tym badaniu te algorytmy pozwoliły nam zidentyfikować rodowody i oszacować współczynniki pokrewieństwa i wskaźniki ryzyka.
Współczynniki pokrewieństwa
Współczynnik pokrewieństwa jest jedną miarą genetycznego związku między dwoma podmiotami. Na przykład, bez pokrewieństwa w poprzednich pokoleniach, współczynnik pokrewieństwa wynosi 1/4 dla rodzeństwa i innych krewnych pierwszego stopnia, 1/8 dla par drugiego stopnia krewnych, 1/16 dla par krewnych trzeciego stopnia, i tak dalej, każda wartość jest o połowę spodziewana część genomu wspólny dla tych krewnych. Formalnie współczynnik pokrewieństwa definiuje się jako prawdopodobieństwo, że losowo wybrany allel z każdego członka pary osobników został odziedziczony po wspólnym przodku21. Średni współczynnik pokrewieństwa pacjentów w obecnym badaniu został obliczony przez uśrednienie współczynników pokrewieństwa każda możliwa kombinacja par pacjentów. Aby ocenić wpływ bliskich związków na wielkość średniego współczynnika pokrewieństwa, obliczyliśmy również średnie współczynniki tylko par pacjentów, którzy nie byli krewnymi pierwszego stopnia i tylko par pacjentów, którzy nie byli pierwsi lub drudzy. krewni stopni. W przypadku tych ostatnich obliczeń wszyscy pacjenci zostali włączeni do obliczeń średniego współczynnika pokrewieństwa, ale nie wszystkie możliwe kombinacje parami. Współczynniki pokrewieństwa dla grup kontrolnych obliczono podobnie.
Ponieważ rodowody były rozległe, nie można było dokładnie obliczyć ogólnego średniego współczynnika pokrewieństwa. Użyliśmy symulacji Monte Carlo do przybliżenia średniego współczynnika pokrewieństwa dla każdej grupy (pacjenci lub osoby kontrolne) i upewniliśmy się, że błędy Monte Carlo miały znikomy wpływ na przedstawione wyniki.
Obliczenia współczynnika ryzyka
Współczynnik ryzyka dla krewnych pacjentów dotkniętych chorobą określono jako ryzyko choroby Parkinsona u krewnych podzielone przez ryzyko w populacji ogólnej; stosunek ten jest bezpośrednio związany z mocą do identyfikacji lub mapowania genów podatności.22 Uzyskanie prawidłowych szacunków współczynnika ryzyka nie jest proste, ponieważ wiele schematów pobierania próbek prowadzi do tendencyjnych lub zawyżonych oszacowań.23 Użycie populacji pacjentów grupy eliminuje znaczna część potencjalnego błędu pobierania próbek
[przypisy: niemiarowość oddechowa, rezonans gdynia, tętno dziwaczne ]
[przypisy: wemurafenib, tropikalne drzewo krzyżówka, przewlekłe zapalenie wyrostka robaczkowego ]